签订、履行合同失职被骗罪是1997年修订刑法增加规定的新罪名，在此之前，这种行为被作为玩忽职守罪的一种表现形式加以处理，1997年修订刑法时将签订、履行合同失职被骗行为从玩忽职守罪中单独分立出来，并按主体的不同分别规定了两个罪名，即刑法第167条规定的签订、履行合同失职被骗罪（其主体为国有公司、企业、事业单位直接负责的主管人员）和第406条规定的国家机关工作人员签订、履行合同失职被骗罪。
1999年9月16日最高人民检察院《关于人民检察院直接受理立案侦查案件立案标准的规定（试行）》将国家机关工作人员签订、履行合同失职被骗罪的立案标准规定为以下两种情形：
1、造成直接经济损失30万元以上的；
2、其他致使国家利益遭受重大损失的情形。参照最高人民检察院的上述规定和上海市、四川省、河南省等地方政法机关有关当地掌握本案定罪量刑标准的规定，最初将本案应予追诉的情形规定为：
1、造成直接经济损失30万元以上的；
2、造成公司、企业、事业单位严重亏损或者无法正常经营的。在讨论和征求意见的过程中，一些地方和部门提出，此规定的数额标准过高，建议适当降低。考虑到现实生活中经济活动的风险性，特别是与国家机关工作人员签订、履行合同失职被骗罪的相互协调问题，根据有关部门和专家学者的建议，对原规定数额标准没有降低，而是适当提高了数额标准，并结合最新有关法律规定和实际发案情况对数额标准根据不同领域作了区别规定。
根据《追诉标准》第12条的规定，涉嫌下列情形之一的，应予追诉：
1、国有公司、企业、事业单位直接负责的主管人员，在签订、履行合同过程中，因严重不负责任被诈骗，造成国家直接经济损失数额在50万元以上的，或者直接经济损失占注册资本30％以上的。造成国家直接经济损失50万元以上和直接经济损失占注册资本30％以上是并列、选择关系，行为人的行为具备其中任何一个条件的，即应予立案。 之所以规定一个直接经济损失与注册资本的百分比条件，是考虑到公司法对不同种类的公司的注册资本要求不一，对于有的公司，50万元已经远远超过其注册资本，而注册资本是一个公司经济实力的基本表现，如果直接经济损失已经达到其注册资本的30％，这对公司来讲已经是非常严重的损失，甚至可能导致倒闭、破产，因而这种情况也应列为应予追诉的情形；
2、金融机构、从事对外贸易经营活动的公司、企业的工作人员，严重不负责任，造成国家外汇被骗购或者逃汇，数额在100万美元以上的。这是根据1998年12月29日全国人大常委会《关于惩治骗购外汇、逃汇和非法买卖外汇犯罪的决定》的有关规定而作出的规定。 根据《决定》第7条的规定，金融机构、从事对外贸易经营活动的公司、企业的工作人员严重不负责任，造成大量外汇被骗购或者逃汇，致使国家利益遭受重大损失的，应该依照刑法第167条的规定定罪处罚，即以签订、履行合同失职被骗罪定罪处罚。考虑到金融、外贸领域失职被骗行为涉及的金额一般都比较大，对这类行为的追诉标准也相应规定了比第一种情形较高的数额标准。 实践中，如果行为人的失职行为致使被骗购或者逃汇的外汇中，包括美元以外的外币的，应以案发时国家外汇管理机关制定的统一折算率折算成美元计算。